La Facultad de Ciencias Aplicadas a la Industria cuenta actualmente con distintas Secretarías que le permiten desarrollar las actividades correspondientes al normal funcionamiento de una Institución de Educación Superior, las mismas son:
- Académica
- Asuntos Estudiantiles
- Extensión
- Ciencia y Técnica
- Posgrado
- Vinculación Tecnológica y Desarrollo Productivo
- Administrativa Financiera
- Comunicaciones e Informática
- Mantenimiento, Obras e Infraestructura
